Este artículo contiene una lista del mejor convertidor gratuito de PDB a PDF software para Windows. Con este software gratuito, puede convertir la estructura molecular almacenada en un archivo de Banco de datos de proteínas (PDB) a Formato de documento portátil ( PDF). Básicamente, puede guardar la vista de una estructura molecular en un formato imprimible como PDF. Para hacerlo, incluso puede personalizar la vista molecular configurando varios parámetros de visualización, como estilo de vista (estructura alámbrica, columna vertebral, palos, relleno de espacio, bolas y palos, cintas, etc.), esquema de colores, mostrar u ocultar etiquetas, vista molecular (átomos, hidrógeno, etc.), etc. También puede rotar o acercar la estructura molecular y luego convertir la vista a formato PDF.
Muchos de estos software enumerados son software de modelado molecular. Por lo tanto, puede modificar la estructura utilizando las herramientas de construcción de moléculas disponibles como agregar átomos, agregar hidrógeno, agregar estructura químicaures, etc. Además, son bastante buenos para la visualización de moléculas, ya que proporcionan un buen conjunto de herramientas de visualización como girar, acercar, ver el modo, mostrar etiquetas, mover, girar, etc. Además, muchos de estos también muestran estadísticas relacionadas con el modelo molecular y proporcionan herramientas de cálculo y análisis.
Además de PDB, también puede convertir otros archivos moleculares a PDF en la mayoría de estos programas. Los formatos de entrada admitidos con mayor frecuencia incluyen MOL, MOL2, ENT, XYZ y CML. En cuanto a la salida, puede convertir PDB a varios formatos de imagen como PNG, BMP, JPG, PS, EPS, etc. Lea el artículo para obtener más información sobre este software.
Mi software de conversión de PDB a PDF gratuito favorito para Windows:
Avogadro es mi software de conversión de PDB a PDF favorito en esta lista, ya que es un software avanzado que también es bueno para la visualización y el modelado de moléculas. También está muy bien diseñado con algunas herramientas adicionales relacionadas con el modelado molecular.
Molekel iEs otra buena que puedes probar para convertir PDB a PDF.
Avogadro
Avogadro es uno de los software gratuitos de modelado molecular de código abierto más populares para Windows, Linux y Mac. También se puede usar para convertir PDB a PDF, ya que proporciona una función dedicada para eso. También puede usarlo para convertir PDB a otros formatos, incluidos PNG, BMP, JPG, SVG, EPS, POV, VRML, etc.
Por lo general, este software se utiliza para la visualización, construcción y edición de moléculas. Para hacerlo, contiene un conjunto rico en funciones de herramientas que se pueden utilizar. Algunas de sus herramientas incluyen proyección en perspectiva u ortogonal, modo de pantalla completa, agregar hidrógenos, insertar (fragmento, ADN/ARN, SONRISAS, y Péptido), Super Cell Builder, Nanotube Builder, Cambiar H a Metilo, Editor cartesiano, etc.
Cómo convertir PDB a PDF en Avogadro:
- Utilizando su función abierta, importe un archivo PDB a este software.
- Edite el modelo molecular con las herramientas disponibles, si es necesario.
- Ahora, vaya a su menú Archivo y haga clic en la opción Exportar > Gráficos vectoriales y seleccione PDF como formato de salida para guardar la vista molecular en formato PDF.
Antes de la conversión de PDB a PDF, puede personalizar la configuración de visualización para exportar una vista personalizada de las moléculas a un archivo PDF o gráfico. Estos ajustes de visualización incluyen mostrar/ocultar ejes, fuerza, dipolo, polígono, anillo, palo, superficies, estructura alámbrica, etc.
Características adicionales:
- Contiene varias extensiones que mejoran aún más su funcionalidad, como Optimizar geometría, Calcular energía, Búsqueda de conformador, Sombreadores GLSL, etc.
- Además de PDB, admite varios formatos de archivo de entrada como CML, XYZ, MOL, MOL2, ENT, GAMOUT, etc.
Conclusión:
Es un gran software gratuito de conversión de PDB a PDF de código abierto que proporciona una buena calidad desalida También puede modificar el archivo PDB antes de iniciar la conversión a PDF o cualquier formato gráfico.
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Molekel
Molekel es un software gratuito de visualización de archivos de moléculas que también se puede utilizar para convertir PDB a PDF. Proporciona una opción directa para convertir archivos PDB a formato PDF. Por lo tanto, puede importar fácilmente un archivo de estructura PDB y luego guardarlo en un archivo PDF. Además, puede convertir otros archivos moleculares a PDF, ya que admite un wila cantidad de formatos de entrada, incluidos XYZ, YOB, ALC, SDF, SMI, RXN, PCM, PQS, MOL, MOL2, TMOL, etc.
Cómo convertir PDB a PDF en Molekel:
- Simplemente abra un archivo PDB que pueda ver y analizar correctamente con sus herramientas de visualización avanzadas.
- Ahora, desde su menú Archivo, haga clic en la opción Guardar en PDF para convertir PDB a PDF.
Características adicionales:
- Puede personalizar varias configuraciones de visualización antes de convertir la estructura PDB a PDF, como fondo, vista de moléculas (bola y palo, palo, estructura alámbrica, etc.), átomo, enlace, propiedades de vista 3D, etc.
- Te permite grabar animaciones moleculares y exportarlas.
- Proporciona algunas funciones de análisis que incluyen sonda plana, distancia, ángulo, ángulo diedro y espectro de radiación.
- Puede convertir PDB y otros archivos de estructuras moleculares a imágenes PS, EPS, PNG y TIFF.
- También puede ver las propiedades básicas del modelo molecular y las estadísticas relacionadas con átomos, enlaces, energía, residuos, confórmeros, masa molar, masa exacta, multiplicidad de espín, frecuencias de vibración, etc.
Conclusión:
Es un buen convertidor de PDB a PDF que también proporciona algunas herramientas avanzadas de visualización molecular.
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RasMol
RasMol es otro software gratuito de conversión de PDB a PDF para Windows. es un lindo lunarvisor de archivos cular que también puede usar para convertir PDB u otro archivo de entrada compatible a varios otros formatos. Estos formatos incluyen BMP, GIF, IRIS RGB, PPM, Sun Raster, PostScript, POVRay, VRML, Raster3D, etc. Sin embargo, para convertir PDB a PDF, deberá usar su función Imprimir. Veamos los pasos ordenados que debe realizar para convertir una estructura molecular guardada en un archivo PDB a PDF.
Cómo convertir PDB a PDF en RasMol:
- Importe un archivo PDB usando la opción Abrir.
- Después de eso, puede configurar la visualización de la estructura molecular utilizando las opciones disponibles, como el modo de vista (estructura alámbrica, columna vertebral, palos, bolas y palos, cintas, hebras, etc.), colores (monocromo, cadena, temperatura, habilitar o deshabilite opciones como modos de losa, hidrógenos, heteroátomos, etiquetas, estéreo, etc., y más.
- Ahora puede usar su función imprimir para convertir la vista personalizada de la estructura molecular PDB a formato PDF.
Coinclusión:
Es otro buen software de conversión de PDB a PDF, ya que también puede convertir PDB a varios otros formatos gráficos como se mencionó anteriormente. Además, admite muchos otros formatos de archivo como entrada además de PDB, como Formato de archivo Alchemy, Formato Sybyl MOL2, Formato de archivo MDL Mol, Formato de archivo CIF, Formato de archivo MOPAC, etc.
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ArgusLab
ArgusLab es un software de construcción molecular gratuito que puede use para convertir PDB a PDF. Usándolo, puede importar y ver fácilmente archivos de datos moleculares como PDB, XYZ, MOL, MOL2, etc., así como convertir estos archivos a otros formatos, incluidos PDF, TIFF, BMP, JPG y POV. Como le permite crear modelos moleculares, también puede editar un archivo PDB antes de la conversión.
Cómo convertir PDB a PDF usando ArgusLab:
- Al principio, abra un archivo PDB que podrá ver en su interfaz.
- Ahora, si es necesario, puede modificar el modelo molecular usando herramientas como modo de traducción, agregar átomos, agregar hidrógenos, eliminar hidrógeno, crear y editar superficies, etc.
- A continuación, para guardar la vista del modelo PDB en formato PDF, haga clic en su menú Archivo > opción Imprimir y seleccione «Microsoft Print to PDF» como impresora. De esta manera, podrá convertir PDF a PDF.
Características adicionales:
- Te permite explorar diferentes elementos de un PDB o cualquier otro archivo molecular como Átomos, Residuos, Grupos, etc.
- esole permite realizar varios cálculos relacionados con el modelo molecular, como energía, optimización de geometría, gaussiana, etc.
Conclusión:
Es un software destacado de construcción de moléculas que también actúa como un convertidor de PDB a PDF.
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Jmol
Jmol es otro software gratuito de conversión de PDB a PDF de código abierto para Windows. Es un buen software de modelado de moléculas con el que puede ver, editar y construir moléculas.archivos ar. Además de PDB, funciona con algunos otros formatos como MOL, MOL2, XYZ, CML, ENT y muchos más formatos de archivo de moléculas inusuales.
Cómo convertir PDB a PDF utilizando este modelador molecular gratuito de código abierto:
- En primer lugar, vaya al menú Archivo y use la opción Abrir para importar un archivo PDB.
- Ahora, puede editar la estructura molecular utilizando las herramientas de modelado disponibles.
- Después de eso, use su función Imprimir para convertir PDB a formato PDF. Al hacerlo, asegúrese de haber configurado la impresora en Microsoft Print to PDF.
Características adicionales:
- Contiene algunas herramientas adicionales que puede usar según sus requisitos, como Animar, Medir, Vibrar, Herramienta de superficie, Crear archivo de entrada gaussiana, etc.
Conclusión:
Es un buen conversor portátil de PDB a PDF que no requiere instalación. Puede usarlo directamente sobre la marcha desde cualquier dispositivo de almacenamiento portátil.
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BALLView
BALLView es otro software gratuito de conversión de PDB a PDF de código abierto en esta lista. Al igual que otros programas enumerados, también le permite importar un archivo PDB y luego imprimir la vista de la estructura molecular en formato PDF. Además de PDF, también puede usarlo para convertir PDB a otros formatos, incluidos PNG, POV, XHTML, VRML y STL.
Además de PDB, admite otros formatos de archivos químicos que puede ver, editar o convertir. Estos formatos de entrada incluyen MOL, MOL2, XYZ, ENT, AC, SD, etc.
Cómo convertir PDB a PDF usando BALLView:
- El primer paso es importar unArchivo PDB usando su opción Archivo > Abrir > Estructura.
- A continuación, use su opción Imprimir y seleccione Microsoft Print to PDF como impresora para convertir PDB a PDF.
Conclusión:
Es otra alternativa decente para convertir un archivo de Protein Data Bank a formato PDF.