Aquí hay una lista de mejor software de flujo libre para Windows. Estos programas gratuitos se utilizan para analizar datos de citometría de flujo almacenados en el estándar de citometría de flujo (FCS) archivos. Algunos de estos también admiten archivos TXT para lo mismo. Estos proporcionan diferentes tipos de diagramas gráficos para visualizar, interpretar y analizar datos de experimentos de citometría de flujo. Estos tipos de gráficos incluyen Gráfico de puntos, Gráfico de densidad, Gráfico de intensidad, Histograma, Histograma de superposición, Distribución acumulativa, etc. . gráficos También puede ver estadísticas totales como eventos, media X/Y, media geográfica, mediana, etc. Una de estas proporciona una gran cantidad de herramientas de análisis estadístico, incluida Calculadora de estadísticas, Calcular la relación de dos parámetros, Calculadora de celdas avanzada, etc.
Para analizar gráficos elaborados, este software también proporciona herramientas como creación de regiones, marcadores, cuadrantes, zoom, panorámica, etc. Estas le permiten guardar datos estadísticos en un archivo TXT. Incluso puede exportar la trama a una imagen como PNG, BMP, etc.
Mi software de flujo libre favorito para Windows:
Flowing Software es mi software de citometría de flujo favorito para Windows. Proporciona una buena cantidad de herramientas para analizar archivos FCS. Además, su interfaz de usuario es bastante sencilla e intuitiva.
Software fluido
Flowing Software es un software de citometría de flujo simple y fácil de usar para Windows. Viene con varias herramientas para analizar datos de experimentos de citometría de flujo. Le permite realizar análisis de citometría de flujo en datos almacenados en archivos FCS y TXT (separados por tabuladores). Proporciona una wila gama de herramientas en diferentes categorías que son las siguientes:
- Herramientas de visualización: esta categoría contiene las principales funciones de análisis gráfico, incluidas Gráfica de puntos, Gráfica de densidad, Gráfica de intensidad, Histograma y Superposición de histograma.
- Herramientas de metadatos: aquí puede encontrar Visor de metadatos, Matriz de compensación, Visor de datos de parámetros y Palabras clave Visor.
- Herramientas de cálculo: Calculadora de estadísticas, Calcular relación de dos parámetros, Calculadora de celdas avanzada y herramientas de Token desde aquí.
- Herramientas de modificación de parámetros: desde aquí, puede cambiar los nombres de los parámetros, cambiar la visualización de lin/log y crear un eje de tiempo.
- Herramientas de modificación de datos: puede encontrar Ganancia virtual y Compensar datos funciona aquí.
- Herramientas de recopilación: esta categoría le ofrece herramientas como Image Collector, Collector List, etc.
- Otras herramientas: algunas herramientas adicionales como Cuadro de texto, Grupo de herramientas, Herramientas de control de regiones, Herramientas de automatización (Folder Runner, Contador de actualizaciones, etc.), etc. son también disponible en este software fluido.
Cómo realizar un análisis de citometría de flujo con Flowing Software
- En primer lugar, desde el menú Archivo, abra Nuevo análisis. Ahora, desde el menú Crear, seleccione una herramienta para el análisis de citometría de flujo. Ahora puede abrir un archivo FCS o TXT que contenga experimentos de citometría de flujo y analizar sus datos relacionados. Le permite seleccionar múltiples herramientas una por una y abrir análisis relacionados en la interfaz principal.
- Puede crear estadísticas (eventos, media, geomedia, medios, etc.), crear regiones, copiar datos al portapapeles, exportar datos a un archivo TXT, etc.
- Puede guardar todo el análisis en su formato nativo para más tardeusar.
En general, este es un excelente software de flujo para realizar análisis de citometría de flujo. Es bastante fácil de usar, pero en caso de que encuentre alguna dificultad, puede consultar este videotutorial.
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FlowPy
FlowPy es el próximo fl libredebido software para Windows en esta lista. Puede abrir un archivo FCS o un archivo de texto y luego elegir un tipo de gráfico para el análisis de citometría de flujo. Proporciona gráficos de histograma, diagrama de puntos y distribución acumulativa para visualizar datos de citometría de flujo. Puede elegir un parámetro para trazar el gráfico respectivo, como FSC-A, FSC-H, FSC-W, SSC-A, SSC-H, SSC-W, Time, etc. Pago este enlace a conocer estos parámetros.
Algunas características de este software de citometría de flujo a tener en cuenta:
- Le permite extraer datos estadísticos completos o datos parciales a un archivo de texto.
- Puede abrir diferentes tipos de gráficos en diferentes pestañas de este software.
- En una pestaña de gráfico, obtienes herramientas como panorámica, zoom, subgráficos, línea, pegar puertas, etc.
- Proporciona la función Clustering para crear gruposrs seleccionando múltiples parámetros. Aquí, obtiene los tipos de clústeres de inicialización estática, división binaria e inicialización aleatoria.
- Proporciona herramientas de análisis de datos, a saber, sustracción de histograma y estadísticas (estadística total y estadísticas de puerta).
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Cyflogic
Cyflogic es otro software de flujo libre para analizar flow datos de citometría. Proporciona herramientas estadísticas Gráfico de puntos, Histograma, Modelador de histograma, Histograma superpuesto, Gráfico 3D y Clipbook para visualizar archivos FCS. Hay muchas funciones proporcionadas en este software que le permiten realizar análisis de citometría de flujo. Estos incluyen las siguientes opciones:
- Puede abrir y ver estadísticas que incluyen número, media X, media Y, % de visible, geomedia X y geomedia Y.
- Le permite personalizar el gráfico usando opciones como Mostrar/Ocultar cuadrante, Mostrar/Ocultar líneas de región, Invertir color de fondo, Habilitar/Deshabilitar multicolores, Cambiar color de gráfico, Mostrar/Ocultar líneas de marcador, Establecer suavizado, etc.
- Puede establecer un límite de sorteo rápido y un número máximo de eventos.
- Puede copiar o incluso guardar datos de trazado como archivo TXT. También le permite exportar el diagrama de trazado como imagen BMP. Además, puede guardar la vista de análisis para su uso posterior.
- Algunas herramientas adicionales que se ofrecen en este software son impresión por lotes, rotación de 360 grados, búsqueda de archivoser, explorador de placas de pocillos, etc.
Nota: Es gratuito solo para uso académico y no comercial.
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FCSalyzer
FCSalyzer es otro software que fluye en esta lista. También le permite abrir y analizar documentos FCS. Veamos los pasos para hacerlo.
Cómo analizar datos de citometría de flujo usando este software gratuito
Primero, debe seleccionar un tipo de tramae desde su interfaz. Le permite analizar datos de citometría de flujo en forma de diagrama de puntos, histograma y diagrama de densidad. Ahora, seleccione un archivo FCS para trazar el diagrama respectivo. Tan simple como eso. Puede usar sus herramientas como Cuadrante, Marcador, Ajustar regiones y puertas, Área de texto, etc. para analizar la trama. También enumera datos sin procesar, estadísticas, etc. También puede exportar estadísticas a un archivo de texto, guardar el gráfico como imagen PNG, exportar eventos del gráfico a un archivo CSV, etc. Le permite guardar el documento de análisis en su formato de archivo nativo para que pueda abrirlo más tarde.
En general, es un software de flujo portátil agradable y. Por lo tanto, puede llevarlo en un dispositivo de almacenamiento portátil y usarlo mientras viaja.
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Sinfonía celular
Cellular Symphony es un tipo diferente de software fluido en esta lista. Es básicamente una representación musical de datos de citometría de flujo donde las células se indican con notas musicales. Simplemente arrastre los archivos FCS a su sección de archivos, elija uno de ellos y luego seleccione los parámetros de tono. Los parámetros de tono incluyen FSC-A, FSC-W, FSC-H, SSC-A, SSC-H, SSC-W, Time, IL2 PE, Dump, etc. Puede obtener más información sobre estos parámetros aquí. Ahora, seleccione los instrumentos respectivos para hacer sonar cada uno. También puede seleccionar el volumen de la nota, la duración de la nota de cada celda, y número total de celdas a sonar. Después de eso, presione el botón de reproducción y se mostrará un diagrama de puntos como puede ver en la captura de pantalla anterior. Puede ajustar el tamaño del punto trazado y habilitar o deshabilitar la cuadrícula también.
También proporciona una opción Grabar para grabar un archivo MIDI de sonido generado. Sin embargo, esta función no me funcionó bien durante las pruebas.
Este también es un software de citometría de flujo portátil que no necesita instalación y se puede utilizar sobre la marcha.