Aquí hay una lista de los mejores servicios gratuitos de creación de árboles filogenéticos en línea. Un árbol filogenético es un tipo de árbol que destaca las relaciones evolutivas entre varias especies. También destaca la divergencia de una especie de otra especie. Si desea crear árboles filogenéticos utilizando varios datos de genoma y secuencia de datos genéticos, puede utilizar estos servicios de creación de árboles filogenéticos en línea. Todos estos servicios son de uso gratuito y se puede acceder a ellos desde cualquier lugar.
En estos servicios, los usuarios pueden ingresar datos del genoma de especies en forma de formatos de archivo Newick, Nexus, FASTA, EMBL, etc. Los usuarios también pueden pegar los datos del genoma de la especie directamente en estos servicios para generar un árbol filogenético. En el árbol generado, los usuarios pueden ver bordes, nodos, nombres de especies, etc. Algunos servicios también usan códigos de color para diferenciar entre varios elementos de un árbol. A través de algunos servicios, los usuarios puedenTambién genera varios tipos de árboles como circular, rectangular, sin raíz, etc. Además de esto, los usuarios también obtienen herramientas para ver, analizar y anotar un árbol filogenético. El proceso para generar un árbol filogenético también es bastante sencillo en todos estos servicios.
Después de ver y analizar un árbol filogenético, los usuarios pueden guardarlo o exportarlo en formatos de archivo PDF, SVG, EPS, TXT, etc. Revisa la lista para saber más sobre estos servicios.
Mi servicio favorito de creación de árboles filogenéticos:
phyloT es mi servicio favorito porque puede generar un árbol filogenético usando varios tipos de datos genómicos y archivos de datos genómicos. Además, también permite a los usuarios anotar el árbol filogenético generado.
phyloT
phyloT es un servicio gratuito de creación de árboles filogenéticos en línea. Este servicio se basa en la taxonomía NCBI o la base de datos de taxonomía del genoma. Con este servicio, los usuarios pueden generar y analizar fácilmente árboles filogenéticos utilizando datos taxonómicos presentes en archivos Newick, Nexus o phyloXML. Antes de generar un árbol filogenético, los usuarios también pueden especificar Tipo de identificador de nodo (Nombres científicos, IDS de taxonomía NCBI, etc.), Nodos internos (contraídos o expandidos), Interrumpir en (especie, clase, orden, sin interrupción, etc.) y más. Después de especificar todos los parámetros, los usuarios pueden generar un árbol filogenético. Ahora, echa un vistazo a las principales características de este servicio en línea.
Características principales:
- Modos de árbol: este servicio en línea puede generar tres tipos de árboles filogenéticos: circular, rectangular y sin raíz.
- Anotaciones manuales: un buen conjunto de herramientas de anotación para anotar manualmente el árbol yeditar información existente también están presentes en él.
- Herramientas de ajuste del árbol: después de generar un árbol filogenético, el usuario puede acercarlo, rotar el árbol, cambiar la etiqueta, cambiar el estilo de fuente del nombre de la especie, ajustar los rangos de colores, y más.
- Herramientas avanzadas: usándolas, los usuarios pueden habilitar o deshabilitar Visualización de metadatos de rama, Opciones de nodo y Punto medio del árbol raíz.
- Exportar: se usa para exportar el árbol filogenético generado SVG, EPS, PDF, PNG, y Texto (Árbol de Newick, archivo PhyloXML , etc.) formatos de archivo.
Pensamiento final:
Es un servicio de creación de árboles filogenéticos en línea rico en funciones a través del cual los usuarios pueden generar, analizar y anotar fácilmente árboles filogenéticos.
filogenia
phylogeny es otro servicio gratuito de creación de árboles filogenéticos en línea. A través de este servicio en línea, los usuarios pueden generar una representación detallada del árbol filogenético. Para generar un árbol filogenético, los usuarios deben ingresar un conjunto de datos de secuencia en formato de archivo FASTA, EMBL, o NEXUS. Los usuarios también pueden ingresar o pegar un conjunto formateado de datos de secuencia en el campo de datos de este servicio. Después de ingresar los datos o el archivo, los usuarios deben hacer clic en el botón Enviar para generar y ver un árbol filogenético. Ahora, echa un vistazo a las principales características de este servicio en línea.
Características principales:
- Descripción general: Muestra un diagrama destacando el proceso para generar un árbol filogenético. El proceso contiene Entrada de usuario, Alineación, Curación, Filogenia, y Representación de árboles.
- Alineación: utiliza la puntuación BLOSUM62 para resaltar la secuencia de datos en varios colores.
- Curación: muestra varios resultados de curación como número de secuencias, alineación asumida, nuevo número de posiciones, bloques de alineación, posiciones de flanco, y más.
- Filogenia: Muestra el diagrama de árbol filogenético sin la representación.
- Representación de árbol: muestra un diagrama de árbol filogenético representado con bordes de secuencia y nodos.
- Acciones: este servicio también permite a los usuarios realizar varios cambios en un árbol filogenético renderizado mediante acciones como enraizamiento en el punto medio, colapso de ramas, intercambio, volteo y más.
- Estilo de árbol: después de representar un t filogenéticoree, los usuarios pueden cambiar su estilo como Filograma, Cladograma, Radial, y Circular.
- Descargar el árbol: utilícelo para descargar el árbol filogenético final en archivos PNG, PDF, SVG, TGF, Newick y TXT. formatos.
Pensamientos finales:
Es otro buen servicio de creación de árboles filogenéticos en línea a través del cual los usuarios pueden generar árboles filogenéticos detallados y renderizados de varios tipos.
Juego de herramientas ETE
Características principales:
- Ver árbol: Después de ingresar los datos de secuencia o archivo a este servicio, presione el botón Ver árbol para iniciar la generación del árbol filogenético.
- Árbol codificado por colores: el árbol filogenético generado por este servicio destaca los diferentes nodos y elementos del árbol en colores únicos.
- Tipo de imagen de alineación: al usarlo, los usuarios pueden generar árboles filogenéticos en formato de bloques alineados, formato condensado y sin formato de alineación.
- Compartir: Este servicio genera un enlace permanentede un árbol filogenético que los usuarios pueden compartir con otros.
Características adicionales:
- Este servicio también ofrece algunas herramientas adicionales como el índice de herramientas filogenéticas, el libro de recetas de herramientas filogenéticas, la referencia de la API de Python, etc.
Pensamientos finales:
Es otro buen servicio de creación de árboles filogenéticos en línea a través del cual los usuarios pueden crear y analizar árboles filogenéticos rápidamente utilizando datos en formato Newick y Fasta.
Creately.com
Creately.com es otro phyloge en línea gratuitoServicio de creación de árboles néticos. Es un servicio estándar de creación de gráficos y diagramas que también se puede utilizar para crear árboles filogenéticos simples. A diferencia de la mayoría de otros servicios similares, no puede crear un árbol filogenético utilizando un genoma y una secuencia de datos. Para generar un árbol filogenético a través de este servicio, los usuarios deben usar manualmente elementos de diagrama estándar como formas, líneas de conexión, bloques de gráficos, etc., para hacer un árbol filogenético. Ahora, echa un vistazo a las características principales de este servicio en línea.
Características principales:
- Formas: esta sección contiene todas las formas y elementos de conexión para hacer un árbol filogenético o cualquier otro tipo de árbol con facilidad. Algunos de los elementos de forma que ofrece son rectángulo redondeado, círculo, triángulo, triángulo rectángulo, octágono, cono, cubo, línea, y más. Además de las formas, también ofrece herramientas de texto para dar nombres a los nodos y bordes de un árbol filogenético.
- Plantillas: este servicioce viene con plantillas para varios tipos de diagramas como Diagrama de red, Diagrama GCP, Diagrama de Gantt, Mapa conceptual, etc. Los usuarios también pueden usar y modificar las plantillas disponibles para convertirlas en un árbol filogenético.
- Exportar: se usa para exportar el árbol final en formatos de archivo PNG, SVG, JPEG y PDF.
Limitación:
- La versión gratuita de este servicio en línea ofrece formas básicas, documentos limitados y herramientas de colaboración limitadas. Además, no es un creador de árboles filogenéticos nativo.
Pensamientos finales:
Es un servicio de creación de árboles filogenéticos en línea decente a través del cual los usuarios pueden crear árboles filogenéticos y varios tipos de diagramas.