Aquí hay una lista de 10 programas gratuitos de visualización de archivos SDF para Windows. SDF es un archivo de datos estructurales y no debe confundirse con un archivo de datos espaciales (AutoDesk). Un archivo SDF molecular contiene datos sobre su disposición estructural, átomos, residuos, conectividad de enlaces y más. Si está buscando visores SDF, puede consultar esta lista. Puede encontrar la característica principal de cada software junto con una breve descripción. Con eso, puede elegir fácilmente el software que mejor se adapte a sus necesidades.
La mayoría de este software es de código abierto con disponibilidad multiplataforma. Cualquiera de los diez programas puede abrir fácilmente un archivo SDF y visualizar los datos de la estructura molecular. Algunos programas ofrecen visualización bidimensional y otros también ofrecen visualización tridimensional. Puede abrir múltiples moléculas para analizar la estructura y encontrar errores estructurales. También puede visualizar las superficies orbitales y de densidad de las moléculas.
Algunos software están repletos de muchas más hazañasUres aparte del visor SDF. Puede abrir varios tipos de archivos y archivos de datos de otros programas de química computacional. Por último, pero no menos importante, puede exportar la visualización a varios formatos, incluidos PDF, PNG, JPG, POV-ray, WRL, OBJ, etc.
Mi visor SDF favorito
Jmol es mi visor de archivos SDF favorito. Es de código abierto y está disponible para Windows, macOS y Linux. Este software tiene una interfaz fácil de navegar donde puede visualizar las estructuras 2D y 3D de las moléculas. Puede visualizar más de 60 formatos de archivo, incluida la compatibilidad con varios archivos de datos de software de química cuántica. Por último, pero no menos importante, le permite exportar la visualización a muchos formatos diferentes, incluidos JPG, GIF, PDF, POV-ray, etc.
Jmol
Jmol es un programa de visualización de moléculas de código abierto. Puede visualizar estructuras químicas en 3D. Este programa puede ejecutarse en fnuestros diferentes modos: programa Java independiente, aplicación web HTML-5, subprograma Java y un componente del lado del servidor «sin cabeza». Este programa puede leer varios tipos de archivos y también puede abrir la salida de QuantumEspresso, Gaussian, MOPAC, GAMESS, CASTEP, CRYSTAL, VMD y muchos otros programas populares.
Características principales:
- Corre en 4 modos diferentes
- Soporte multilingüe
- Ver estructuras de moléculas y materiales
- Admite más de 60 formatos de archivo, incluidos PDB, PyMOL, SDF, MOL, CIF, SDF, MOL, PSE, etc.
- Admite tipos de archivo de varios software de química cuántica
- Abrir y comparar varios archivos
- Capacidad completa de simetría cristalográfica
- Exportar a formatos PDF, GIF, PNG, JPG, WRL, POV-Ray y OBJ
- Interfaz de usuario personalizable y más
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IQmol
IQmol es un editor y visualizador de moléculas gratuito y de código abierto. Este programa puede abrir fácilmente SDF y muchos otros tipos de archivos. Viene con un editor molecular que también puede generar superficies orbitales y de densidad con animación. IQmol está integrado con el paquete de química cuántica Q-Chem. Esto ofrece a los usuarios un entorno intuitivo para configurar, ejecutar y analizar los cálculos de Q-Chem.
Características principales:
- Código abierto y multiplataforma
- Soporte multilingüe
- Dibujar y ver estructuras de moléculas y materiales
- Constructor de forma libre con m integradomecánica olecular
- Admite varios formatos de archivo de química computacional
- Vista de modelo jerárquico
- Visualización de orbitales moleculares y densidades
- 4 vistas de modelo que incluyen tubos, estructuras alámbricas, VDW y CPK
- Compatibilidad con la biblioteca OpenBabel
- Generar archivos de película de animación de moléculas
- Exportación a Exportación de espectros y POV-ray
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Avogadro
Avogadro es otro programa editor y visualizador de moléculas multiplataforma gratuito. Está disponible para Windows, macOS y Linux. Este programa se utiliza para química computacional, modelado molecular, bioinformática, ciencia de materiales y áreas relacionadas. Avogadro puede abrir fácilmente archivos SDF con renderizaciones de alta calidad.
Características principales:
- Código abierto y multiplataforma
- Soporte multilingüe
- Dibujar estructuras de moléculas y materiales
- Admite varios formatos de archivo de química computacional
- Importación de Open Babel de archivos químicos
- Generación de entrada para múltiples paquetes de química computacional
- Extensiones para funciones adicionales
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Molekel
Molekel es un programa gratuito de visualización de moléculas que puede ver archivos SDF. Este es un programa de código abierto disponible para Windows, macOS y Linux. Utiliza diferentes métodos para representar rápidamente las estructuras de las moléculas y visualiza las superficies orbitales, las superficies SAS, las superficies SES, las superficies de Van der Waals, la superficie iso de la matriz de densidad y la superficie iso de los datos de cuadrícula del cubo gaussiano.
Características principales:
- Código abierto y multiplataforma
- Soporte multilingüe
- Visualizar estructuras de moléculas y materiales
- Admite varios formatos de archivo de química computacional
- Animación de superficies moleculares
- Animación de modos vibracionales
- Sombreadores programables
- Exportar a imagen de alta resolución, PDF, PostScript y animación
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Swiss-PdbViewer
Swiss-PdbViewer es un programa multiplataforma gratuito que puede visualizar archivos SDF. También se conoce como DeepView. Este programa puede ver y analizar múltiples proteínas al mismo tiempo. Puede superponer moléculas para comparar y deducir sus alineaciones estructurales. puede venirpare modelos para encontrar errores de modelo, calcular superficies, potenciales electrostáticos, examinar mapas de densidad de electrones y mucho más.
Características principales:
- Multiplataforma
- Soporte multilingüe
- Visualizar estructuras de moléculas y materiales
- Admite varios formatos de archivo de química computacional
- Superficies de color a través de átomos o cavidades
- Exportar a POV-ray
- Amplia integración con servidores web
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Visor molecular de Molegro
Molegro Molecular Viewer es un software gratuito para visualizar moléculases y Molegro Virtual Docker resultados. Este software está disponible solo para Windows. Puede preparar moléculas automáticamente y visualizar las superficies y la columna vertebral de las moléculas. Puede recortar las moléculas y recortar los planos. Este software admite archivos Molegro Virtual Docker MVDML y alinea la estructura de la proteína.
Características principales:
- Ver y compartir estructuras moleculares y materiales
- Soporte multilingüe
- Importa y exporta formatos de archivos moleculares comunes como PDB, SDF, Mol2, etc.
- Admite archivos Molegro Virtual Docker MVDML
- Trazador de rayos integrado para imágenes de alta calidad
- Etiquetas, visor de secuencias
- Generador de biomoléculas
- Soporte para flujos de trabajo KNIME
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CueMol
CueMol es otro programa multiplataforma para ver archivos SDF. Este programa también está disponible para macOS y Linux junto con Windows. Es bueno para la visualización de estructuras macromoleculares y también puede crear estructuras moleculares. CueMol puede abrir fácilmente coordenadas moleculares (formato PDB), datos de superficie MSMS, mapa de potencial electrostático APBS (formato OpenDX) y densidad electrónica (formatos CCP4, CNS y MTZ).
Características principales:
- Multiplataforma
- Vistas moleculares basadas en pestañas
- Visualizar molécula con renderizado de bordes
- Compatibilidad con escenas multimoleculares
- Admite varios formatos, incluidos PDB, MSMS, OpenDX, X-PLOR/CNS, MAP, etc.
- Almacenar y restaurar escenas en formato XML
- Animar el movimiento de la cámara y la transformación de la estructura
- Exportar aPOV-ray y creación de películas
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iMol
iMol es otro programa gratuito de visualización de moléculas de código abierto. Está disponible para Windows y Linux. Puede visualizar formatos de archivo de datos estructurales de química computacional comunes, incluido el formato MDL MOL. Puede abrir múltiples estructuras moleculares al mismo tiempo con múltiples estilos de representación y también puede animar las trayectorias de dinámica molecular y trayectorias de dinámica molecular, residuos y átomos.
Características principales:
- Código abierto
- Soporte multilingüe
- Vista jerárquica de molecreglas
- Representación estéreo
- Átomos moleculares animados, trayectorias dinámicas
- Coloreado de la superficie y la columna vertebral
- Exportar a POV-ray
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BALLView
BALLView es un programa independiente ofrecido por BALL Project. Este programa está diseñado para facilitar el modelado y la visualización molecular. Puede visualizar fácilmente átomos, enlaces y superficies. Además, también admite visualizaciones basadas en cuadrículas como potenciales electrostáticos. Puede abrir múltiples moléculas simultáneamente.
Características principales:
- Soporte multilingüeorto
- Visualizar estructuras de moléculas y materiales
- Admite formatos de archivo de química computacional comunes
- Modo estéreo diferente con navegador espacial
- Dispositivos de entrada compatibles con VRPN
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Lector SDF
SDFReader es un programa gratuito para ver archivos de datos de estructura. Este es un programa de código abierto disponible para Windows y Linux. Es un programa simple con una interfaz mínima. Los usuarios pueden abrir directamente el archivo SDF para visualizarlo. Luego, este programa muestra la estructura de la molécula junto con datos adicionales almacenados en el archivo SDF.
Características principales:
- Código abierto
- Soporte multilingüe
- Ver estructuras de moléculas y materiales
- Datos Sve en formato de base de datos sqlite3